どうも初めまして管理人様。ピカチュウと申します。これからよろしくお願いします。早速ですが本題に入らして頂きます。タイトルのとうり
『トパーズ』なのですが砂漠の地下のニーサに話しかけても『上から来たか、帰れ！』と言われ、イベントが進みません。アイシャは主人公じゃないですが、仲間には入れてます。敵はスカルゴイルが出現するくらいまで、敵と戦っています。何故話してくれないのでしょうか？

ピカチュウさん、こんにちは。
上から来たな、帰れ、といことは砂漠の地下のまだまだ半分ですね。
ニーサの祭壇はそこからさらに奥にありますので、
そこから左奥の方へ行ってみましょう。
なお、トパーズを入手した後はそこまで戻ってくると良いですよ。

スカルゴイルがわんさわんさと出ている状況では大変でしょうが・・・